Nació en Tulle el 24 de diciembre de 1630, y falleció en París el 28 de julio de 1718. Su educación se inició en la universidad jesuita de su ciudad natal, donde tomó las órdenes menores y se distinguió por su inteligencia, su constancia para estudiar, y su prodigiosa memoria. Obtuvo una beca por recomendación de sus profesores y completó sus estudios clásicos en el Colegio de San Marcial, que había sido fundado en Toulouse en el siglo XIV por el Papa Inocencio VI, para alojar únicamente a veinte estudiantes escogidos. Resuelto a dedicarse al estudio de la literatura antigua y a la historia, y crítico con la investigación de los hechos, se comprometió a estudiar los orígenes de la Nación Francesa, sus costumbres, leyes e instituciones, utilizando para ello sólo documentos auténticos y registros originales en lugar de leyendas e historias fabulosas, introduciendo así un espíritu científico en la investigación histórica, la cronología y la filología. En 1654, Pierre de Marca,  Arzobispo de Toulouse, uno de los mayores estudiosos franceses en el siglo XVII, le nombró su secretario. A su muerte, en junio de 1662, Baluze pública la "Marca Hispánica", una notable obra histórica y de descripción geográfica de Cataluña. Este trabajo le dio a conocer a Jean Baptiste Colbert, quien lo nombró su bibliotecario, cargo que ocupó durante treinta años. La excelente colección de manuscritos y libros de la Biblioteca Colbertina, son el fruto de su cuidado y asesoramiento. Escudriñó librerías, compró colecciones privadas, y mantuvo correspondencia con eruditos extranjeros para adquirir libros para la colección. Con él la Biblioteca Colbertina creció enormemente. Su propia colección también fue importante, ya que comprendía alrededor de 1100 libros impresos, 957 manuscritos, más de 500 mapas y siete cajas llenas de documentos diversos. En estos libros aparece su firma con su nombre en latín "Stephanus Baluzius" como ex libris. Baluze merece ser recordado entre aquellos benefactores de los libros, que emplearon su vida y saber en la recopilación de todo tipo de fuentes manuscritas antiguas, libros preciosos y documentos estatales. Los anotó con valiosos comentarios sobre la historia profana y eclesiástica, así como sobre el derecho canónico, antiguo y moderno. La cantidad de obras publicadas por Baluze es considerable. Entre las más importantes podemos mencionar: Capitularia Regum Francorum (1677); Nova Collectio Conciliorum (1683); Vitae Paparum Avenionensium (1693); Histoire généalogique de la maison d"Auvergne (1708); Historia Tutelensis (1716).